ABSTRACT Objective: To report a rare case of a patient with a molecular diagnosis of Kleefstra syndrome (KS) who has four other chromosomal alterations involving pathogenic variants. Case description: Male patient, two years old, with global delay, including in neuropsychomotor development, ocular hypertelorism, broad forehead, brachycephaly, hypotonia, ligament laxity, unilateral single palmar crease and arachnoid cyst. The microarray-based comparative genomic hybridization (a-CGH) identified copy number variations (CNVs) in five regions: 9q34.3, 6p22.1, Yq11.223, Yp11.23, and 2q24.1. The heterozygous microdeletion in 9q34.3 involving the EHMT1 gene confirms the diagnosis of KS. Comments: The presence of pathogenic CNVs and/or those of uncertain significance, located on chromosomes 2, 6 and Y, may be contributing to a variability in the patient's clinical condition (arachnoid cyst, single palmar fold and ligament laxity), compared to other individuals with only KS genetic alteration, making the dignosis of the disease harder.

RESUMO Objetivo: Relatar um caso raro de paciente com diagnóstico molecular de síndrome de Kleefstra (SK) que apresenta quatro outras alterações cromossômicas envolvendo variantes patogênicas. Descrição do caso: Paciente masculino, dois anos de idade, com atraso global de desenvolvimento neuropsicomotor, hipertelorismo ocular, fronte ampla, braquicefalia, hipotonia, frouxidão ligamentar, prega palmar única unilateral e cisto aracnoide. Exame de hibridização genômica comparativa (a-CGH) identificou variações de número de cópias (CNV) em cinco regiões: 9q34.3, 6p22.1, Yq11.223, Yp11.23 e 2q24.1. A microdeleção heterozigótica em 9q34.3 confirma o diagnóstico de síndrome de Kleefstra. Comentários: A presença das CNV patogênicas e/ou de significado incerto, localizadas nos cromossomos 2, 6 e Y, pode estar contribuindo para uma variabilidade no quadro clínico do paciente (cisto aracnoide, prega palmar única e frouxidão ligamentar) em relação a outros indivíduos somente com alteração genética da SK, dificultando o diagnóstico da doença.

ABSTRACT Objective: Autism spectrum disorder (ASD) affects cognitive development and social interaction on different levels. Genetic and environmental factors are associated with secondary ASD. Genetic inheritance is mainly polygenic, and 10% are copy number variations (CNVs). Array comparative genomic hybridization (array-CGH) is used to identify CNVs. This report aimed to discuss autism spectrum disorder and its diagnosis by array comparative genomic hybridization, highlighting the association with the pathogenic duplication of 17q12q21.2. Case description: A male baby was born at 37 weeks’ gestation by cesarean section. The child showed strabismus, cryptorchidism, hypertelorism, frontal bossing, and developmental delay, walking at 25 months and talking at 4 years. At the age of 2 years, array-CGH of peripheral blood revealed a 5.6-Mb 17q12q21.2 duplication or arr 17q12q21.2 (34,815,527-40,213.109)x3 encompassing 190 genes, including HNF-1B and LHX1. The child was clinically diagnosed with ASD. Comments: Changes in the 17q12 segment, such as the duplication found, have been associated with the development of several problems in previous studies, mainly kidney diseases and behavioral disorders. Located at this chromosome region, HNF1's homeobox B codes a member of the superfamily containing homeodomain of transcription factors. Another gene associated with abnormalities in neurological development regarding 17q12 deletions is LHX1, as shown in this case study. LHX1 plays a role in the migration and differentiation of GABA neurons, modulating the survival of pre-optical interneurons, thus affecting cellular migration and distribution in the cortex. Changes in this control result in flaws in interneuron development, contributing to the pathophysiology of psychiatric diseases.

RESUMO Objetivo: O transtorno do espectro autista (TEA) afeta o desenvolvimento cognitivo e a interação social em diferentes níveis. Fatores genéticos e ambientais estão associados a TEA secundário. A herança genética é principalmente poligênica e, em 10%, são variações do número de cópias (CNV). A hibridização genômica comparativa de array (array-CGH) é usada para identificar CNV. Este relato objetivou discutir o TEA e seu diagnóstico por array-CGH, destacando a associação com a duplicação patogênica do 17q12q21.2. Descrição do caso: Um bebê do sexo masculino nasceu com 37 semanas de gestação por cesariana. A criança apresentou atraso no desenvolvimento, andando aos dois anos e um mês e falando aos quatro, exibindo estrabismo, criptorquidia, hipertelorismo e saliência frontal. Aos dois anos, o array-CGH de sangue periférico revelou duplicação de 5,6 Mb 17q12q21.2 ou arr 17q12q21.2 (34.815.527-40.213.109) x3 abrangendo 190 genes, incluindo HNF1B e LHX1. A criança foi clinicamente diagnosticada com TEA. Comentários: Alterações no segmento 17q12, como a duplicação encontrada, têm sido associadas ao desenvolvimento de patologias renais e distúrbios comportamentais. Localizado nessa região cromossômica, o HNF1B codifica um membro da superfamília que contém o domínio dos fatores de transcrição. Outro gene foi associado a anormalidades neurológicas, em relação às deleções 17q12, o LHX1, como mostrado neste caso. O LHX1 desempenha um papel na migração e diferenciação dos neurônios GABA, modulando a sobrevivência dos interneurônios pré-ópticos e afetando, assim, a migração e distribuição celular no córtex. Mudanças nesse controle resultam em falhas no desenvolvimento dos interneurônios, contribuindo para a fisiopatologia das doenças psiquiátricas.

ABSTRACT A total of 1.67 million breast cancer cases per year are reported worldwide. Of these, 5%–10% are caused by inherited mutations. Phenocopy is a rare phenomenon, with only a few cases reported in the literature. In phenocopies, phenotypes identical to those with genetic origin occur because of environmental factors rather than familial mutations. We describe a case of phenocopy in a 44-year-old female patient with triple-negative breast cancer. The mother and sister wee heterozygous for c.1813delA, p.Ile605TyrfsTer9 in BRCA2 . The patient underwent genetic testing for BRCA1 and BRCA2 and exome sequencing. Familial or other cancer variants were not detected. The most accepted phenocopy theory is that patients without genetic variants but who are carriers of these mutations undergo cellular changes due to environmental factors, increasing the risk of breast cancer. Therefore, the detection of phenocopy in patients with breast cancer is important in clinical practice.